У цианобактерий выделяют 3 класса:

Класс Хроококковые включает одноклеточные и колониальные формы. У большинства колонии образуются за счет выделения огромной массы слизи. К этому классу относится, например колониальные водоросли микроцистис, глеокапса. Глеокапса живет в небольших пересыхающих водоемах, на поверхности сырой почвы, часто в цветочных горшках в виде сине-зеленого налета. Клетки водоросли заключены в слизистый футляр. Дочерние клетки после деления вырабатывают свою слизистую обертку, при этом клетки остаются связанными под общей слизистой оболочкой колонии. По количеству оболочек можно подсчитать сколько раз делилась клетка. Микроцистис является типичным планктонным организмом. Колонии микроцистиса имеют неправильную форму. Клетки, составляющие колонию, шаровидные мелкие, погруженные в слизь. В клетках образуются большие газовые вакуоли. Это частые возбудители цветения воды.

Класс Хамесифоновые – это нитевидные, ложнопаренхимные и колониальные водоросли. Размножаются спорами. Ведут, как правило, прикрепленный образ жизни, предпочитают чистые реки.

Класс Гормогониевые. Представители этого класса нитчатые водоросли, размножающиеся гормогониями. К ним относятся осциллатория, лингбия, анабена, носток. Осциллатория широко распространена в стоячих водоемах с загрязненной водой. Она образует слизистые налеты на влажной почве, на подводных камнях или плавает на поверхности в виде слизистых лепешек. Носток встречается в разных экологических условиях. Одни виды живут в небольших прудах, другие на поверхности сырой почвы, третьи – на почве в степных, полупустынных и пустынных районах. Колонии ностока, живущие в прудах, имеют шарообразную форму и слизисты на ощупь. Анабена несколько напоминает носток, нити ее кольцеобразно или спирально скручены. В нитях имеются гетероцисты. У спирулины нити тоже спирально закручены. Иногда две нити, перевиваясь друг с другом, образуя своеобразную «веревочку».